微生物实验室，主要服务于水务以及环境工程技术相关专业的师生开展实验教学和开放性实验活动。主要承担《水处理微生物学》、《环境微生物学》等课程的实验教学任务。具有生物显微镜、恒温培养箱、无菌操作台、高压灭菌锅、电冰箱、鼓风干燥箱等主要设备，并配备大肠杆菌、枯草杆菌、四联球菌等教学用菌群标本。该室基础设施齐全完善实验教学仪器设备性能良好，完全满足教学和开放实验要求。开设实验项目有光学显微镜的操作及微生物个体形态的观察、微型动物计数、细菌霉菌酵母菌放线菌形态的观察、微生物的染色、培养基的制备及灭菌、细菌纯种分离培养和接种技术、细菌总数的测定、大肠菌群数的测定、微生物细胞大小的测量等实验。